一般而言，使用第一代均質腔的設備價格較低，但均質性能不如第二代。使用第二代均質腔的設備，對乳劑的均質效果優良，但處理高濃度、高粘度物料時，較第一代產品更易阻塞，且價格相對較高。所以最終的選擇應當根據產品需求和整體性價比來進行確定。
最高均質壓力
一般情況下，均質壓力越高越好。首先，均質壓力越高，均質后的物料粒徑將越小越均勻。這就使設備的效率更高，可以通過更少的循環次數達到期望的效果；其次，均質壓力越高，可以處理的物料種類越多。例如，某些液體乳劑只需要在20000psi就可以均質到100nm以下，而某些含有較高密度固體顆粒的混懸液，則至少要26,000psi以上的壓力下才能處理到納米級。
但同時需要注意的是均質壓力越高，發熱量則越大，高溫會影響物料的均質效果。所以，一般在沒有降溫措施的情況下，30000psi是超高壓勻質的最高壓力。
發展方向
隨著我國制造技術的不斷發展，已經有很多國產均質機應用在食品、化工等諸多行業。但是，自1986年中國生產第一批藥用脂肪乳以來，醫藥行業使用的超高壓勻質機幾乎全部來源于進口。其中，最主要的原因就是國產高壓均質機的核心部件高壓均質腔無法達到行業所需的技術要求。
2010年美國食品與藥物管理局（FDA）發布公告，在全美召回11批丁酸氯維地平注射用乳劑。召回原因為產品中可能含有惰性金屬顆粒物質。如果這些顆粒發生聚集形成更大的顆粒，理論上將導致毛細血管血流減少，進而引發某些組織的機械性損傷，以及引起急性或慢性炎癥反應。某些組織血供減少還可能引起腦、腎、肝臟、心臟、肺等器官缺血或功能不全。因此，在醫藥行業，不推薦使用第一代碰撞型均質設備。業界常見的碰撞型均質設備早期產品和絕大多數國產機型，這些機型已不適合進行注射用乳劑的大規模生產。
今后，國產高壓均質機需要不斷提高核心部件高壓均質腔的制造技工藝，才可以在醫藥、半導體、微電子等高精尖領域得到更加廣泛的應用。
